| Таблица 1. Группы банков данных. | |
|---|---|
| Банк данных | Группа |
| Swiss-Prot | UniProt Universal Protein Resource |
| EMBL | Nucleotide sequence databases |
| PDB | Protein function, structure and interaction databases |
| Таблица 2. Таксон гамма-протеобактерии | |
|---|---|
| Название таксона | GAMMAPROTEOBACTERIA |
| Количество документов в Swiss-Prot | 34805 |
| Таблица 3. Запросы | ||
|---|---|---|
| Цель | Строка запроса | Количество найденных документов |
| Поиск своего белка | "[swissprot-AccNumber:P0A955*]" | 1 |
| Поиск белков из организмa Vibrio cholerae, которые выполняют функцию, сходную с функцией моего белка | "([libs={taxonomy uniprot}-AllText:GAMMAPROTEOBACTERIA*] & ((([libs-AllText:Phospho-2-*] & [libs-AllText:dehydro-3-deoxygluconate*]) & [libs-AllText:aldolase*]) | [libs-AllText:Phospho-2- dehydro-3-deoxygluconate aldolase* ])) " | 6 |
| "((([uniref100-Description:2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate* ] & [uniref100-Description:aldolase*]) | [uniref100-Description:2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate al dolase*]) & (([uniref100-Organism:Vibrio*] & [uniref100-Organism:cholerae*]) | [uniref100-Organism:Vibrio cholerae*])) " | 2 |
| Таблица 4. Описание выборки | ||||
|---|---|---|---|---|
| № | ID | AC | Организм | Таксон |
| 1 | ALKD_ERWCH | P38488 | ERWINIA CHRYSANTHEMI | ENTEROBACTERIALES; ENTEROBACTERIACEAE; DICKEYA. |
| 2 | ALKH_ECO57 | P0a957 | ESCHERICHIA COLI O157:H7. | ENTEROBACTERIALES; ENTEROBACTERIACEAE; ESCHERICHIA. |
| 3 | ALKH_ECOL6 | P0a956 | ESCHERICHIA COLI O6. | ENTEROBACTERIALES; ENTEROBACTERIACEAE; ESCHERICHIA. |
| 4 | ALKH_ECOLI | P0a955 | ESCHERICHIA COLI. | ENTEROBACTERIALES; ENTEROBACTERIACEAE; ESCHERICHIA. |
| 5 | ALKH_PSEPU | P00885 | PSEUDOMONAS PUTIDA. | PSEUDOMONADALES; PSEUDOMONADACEAE; PSEUDOMONAS. |
| 6 | ALKH_SHIFL | P0a958 | SHIGELLA FLEXNERI. | ENTEROBACTERIALES; ENTEROBACTERIACEAE; SHIGELLA. |
Главная страница 2-го семестра